杨娜¹ , 王鹤¹ , 孙明阳¹ , 关鑫¹ , 王长宝^2*

1 佳木斯大学理学院, 佳木斯, 154007; 2 玉林师范学院生物与制药学院, 玉林, 537000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 28 篇   
收稿日期: 2019年10月13日    接受日期: 2019年10月15日    发表日期: 2020年12月11日

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以NCBI核酸数据库中关苍术DNA序列为研究对象，筛选出ITS和atpB-rbcL两个目标片段，利用MEGA6.0和DnaSP6.0分别对所获得的序列进行分析，为全面了解关苍术的种内变异和苍术属的物种界定提供依据。结果显示：(1) 30条ITS序列中包含20个单倍型，有信息位点15个，平均杂合子2.2，平均缺失位点2.3，单倍型多样性与核苷酸多样性较高，分别为0.744和0.003 63，核苷酸平均差异值为2.267；(2) ITS序列保守值为0.953，最小窗口长度为60，共发现2个保守区域，分别长129 bp和77 bp；(3)所有26条atpB-rbcL序列中有9个单倍型，单倍型多样性为0.665，种内平均遗传距离0.001 6，核苷酸多样性为0.001 6，转换/颠换为1.163；(4) atpB-rbcL序列保守值为0.985，最小窗口长度为179，1个保守区域长度为263 bp；(5) 两种序列构建的邻接法系统树均支持将关苍术划分成两个主要分支。本研究认为：(1) 关苍术种内变异丰富， ITS序列致同进化不完全无法直接测序使用， atpB-rbcL序列在解决其种内变异问题上具有特殊的优势。(2) 关苍术基因组来源于两个不同的谱系，可能是一个混合类群。

关苍术(Atractylodes japonica)；序列特征；种内变异；系统发育分析